Revisión histórica, distribución potencial y estado de conservación de la rata endémica de México Xenomys nelsoni (Rodentia: Cricetidae) / Historical review, potential distribution, and conservation of the Mexican endemic rat Xenomys nelsoni (Rodentia: Cricetidae)

Resumen Introducción: La Rata de Magdalena, Xenomys nelsoni, es un roedor endémico de México, de distribución restringida a las selvas bajas caducifolias densas, en una pequeña región de la costa del Pacífico mexicano. Es una especie poco conocida, catalogada como "En Peligro" de acuerdo con la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (IUCN). Este desconocimiento unido a la alta tasa de deforestación de su hábitat hace que su conservación sea prioritaria. Objetivo: Realizar un recuento histórico de los registros depositados en las colecciones científicas, generar mapas de distribución potencial y analizar el estado de conservación de la especie. Método: Los datos de ocurrencia de las especies se obtuvieron de la literatura y bases de datos digitales y se analizaron por décadas. Se utilizaron los programas GARP y MaxEnt para generar los modelos de nicho ecológico. La importancia de las variables en el modelo se estimó mediante un análisis Jackknife. Resultados: A lo largo de 129 años 19 recolectores registraron 69 ejemplares, de los cuales 65 están depositados en siete colecciones internacionales y una nacional. Aunque la especie sólo se ha recolectado en Jalisco y Colima, la distribución potencial de X. nelsoni incluye también el estado de Michoacán. De esta área estimada, sólo el 1.5 % se encuentra dentro de un Área Natural Protegida. Conclusiones: Los resultados de la distribución potencial podrían ser utilizados para verificar la presencia de la especie en lugares donde no ha sido recolectada como el norte de la Reserva de la Biosfera Chamela-Cuixmala y en algunas zonas de la provincia fisiográfica Costas del Sur en el estado de Michoacán. Es necesario incrementar los muestreos en regiones poco estudiadas predichas por el modelo y aumentar el área de protección.

Abstract Introduction: The Magdalena Rat, Xenomys nelsoni, is a rodent endemic to Mexico, whose distribution is restricted to dense tropical dry forests in a small region on the Pacific coast of Mexico. It is a poorly known species categorized as "Endangered" by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). This lack of knowledge and the high rates of deforestation of its habitat makes its conservation a priority. Objective: To summarize the historical records deposited in scientific collections, to create potential distribution maps, and to analyze the conservation status of the species. Methods: We obtained species occurrence data from literature and digital databases, analyzing them by the decade. We used GARP and MaxEnt software to generate the ecological niche models. The importance of the variables in the model was estimated using the Jackknife technique. Results: Over 129 years, 19 collectors registered 69 specimens, of which 65 are deposited in one national and seven international collections. Although the species has only been collected in Jalisco and Colima, the potential distribution for X. nelsoni also includes the state of Michoacán. Of this estimated area, only 1.5 % is in a Protected Natural Area. Conclusions: The results of the potential distribution could be used to verify the presence of the species in places where it has not been collected, such as the northern part of the Chamela-Cuixmala Biosphere Reserve and in some areas of the physiographic province Costas del Sur in the state of Michoacán. It is needed to increase samplings in the least studied regions predicted by the model and expand the area of protection.

Biogeografía del tomate Solanum lycopersicum var. cerasiforme (Solanaceae) en su centro de origen (sur de América) y de domesticación (México)

El tomate (Solanum lycopersicum) es una de las principales hortalizas en el mundo debido a las importantes ganancias económicas que genera su comercialización; sin embargo, a pesar de que la especie es ampliamente cultivada en el mundo, su diversidad genética se considera restringida. Esto hace que su resistencia a plagas y enfermedades en las variedades actualmente cultivadas sea baja. Existe la forma silvestre S. l. var ceraciforme que se distribuye desde Suramérica (centro de origen) hasta México (área de domesticación), específicamente en la vertiente del Golfo de México en Veracruz. Como objetivo, se quiso identificar patrones de diversificación ambiental con los que se pudiesen inferir procesos de adaptación de las poblaciones en el área de domesticación con respecto a su centro de origen. Asimismo, se planteó proponer medidas de conservación y rescate del tomate S. l. var. cerasiforme. Se realizaron modelos de nicho ecológico (MNE) con Maxent versión 3.4.1 (evaluados con AUC y ROC-parcial) para determinar la idoneidad de las condiciones ambientales, incluyendo proyecciones del centro de domesticación al área de origen y viceversa. Esto se realizó con base en ocho variables de temperatura y precipitación. Los registros de tomate fueron tomados de fuentes bibliográficas y trabajo de campo. Seguidamente, se realizó la prueba de comparación de nichos (equivalencia y similitud), propuesta por Broennimann et al. (2012), para evaluar la similitud de condiciones ambientales en ambas regiones. Posteriormente, se realizó un análisis de varianza seguido de una prueba de comparación de medias (Tukey, P ≤ 0.05) con las ocho variables ambientales utilizadas. Los valores de AUC (0.93 y 0.80) y ROC-parcial obtenidos (1.86 y 1.71; P = 0.0001) de los MNE muestran que fueron buenos modelos predictores. Se observó que en el centro de México existen condiciones ambientales similares a las del centro de origen, a diferencia de la vertiente del Golfo de México donde son diferentes. La prueba de equivalencia mostró que la comparación ambiental entre ambas regiones es menos equivalente que lo esperado por azar (P = 0.003). Mientras tanto, la otra prueba indica que la similitud que existe entre ambas regiones también se puede obtener por azar (P = 0.683). También, se encontraron diferencias significativas en tres variables de temperatura y precipitación. En conclusión, el centro de origen y de domesticación de S. l. var. cerasiforme tienen características ambientales en común a pesar de la distancia geográfica, pero existen zonas geográficas (vertiente del Golfo de México en Veracruz) en el área de domesticación con condiciones ambientales diferentes a las de su centro de origen y con un potencial importante como bancos de germoplasma.

The tomato (Solanum lycopersicum) is one of the main horticultural crops in the world because of the important economic benefits that its commercialization generates. Even though the species is widely cultivated in the world, it is susceptible to pests, diseases, and environmental stresses due to the loss of its genetic diversity. There is a wild form called S. l. var ceraciforme that is distributed from South America (its center of origin) to Mexico (its area of domestication), specifically on the slope of the Gulf of Mexico in Veracruz. Due to the large genetic diversity of these wild tomatoes, it is important to improve its crop. The objective of this investigation was to identify patterns of environmental diversification of the tomato, infer the processes of adaptation of the populations in the area of domestication with respect to their center of origin and propose measures of conservation and variation of S. l. var. cerasiforme. We generated two ecological niche models (MNE) with Maxent version 3.4.1 (evaluated with AUC and partial-ROC) to determine the suitability of environmental conditions including their respective projections from the domestication center to the area of origin and vice versa. We used eight variables of temperature and precipitation. Additionally, we included tomato records from bibliographical sources and fieldwork. We also used the niche comparison test (equivalency and similarity) proposed by Broennimann et al. (2012) to evaluate the similarity of environmental conditions in both regions. Subsequently, we carried out an analysis of variance followed by a mean comparison test (Tukey, P ≤ 0.05) with all environmental variables measured. The values of AUC (0.93 and 0.80) and partial-ROC (1.86 and 1.71, P = 0.0001) of the MNE showed that they were good predictive models. We observed that, in the center of Mexico, there are environmental conditions similar to those of the center of origin, unlike the slope of the Gulf of Mexico where they are different. The equivalency test showed that the environmental comparison between both regions is less similar than expected by chance (P = 0.003). The similarity test indicated that the existing similarity between both regions can also be obtained by chance (P = 0.683). We also found significant differences in three temperature and precipitation variables. In conclusion, we determined that the center of origin and domestication of S. l. var. cerasiforme has similar environmental characteristics despite the geographic distance; nevertheless, there are geographical zones (the Gulf of Mexico in Veracruz) in the area of domestication with different environmental conditions. Those places have the potential to contain valuable germplasms.

Trans-Amazon dispersal potential for Crotalus durissus during Pleistocene climate events / Potencial de dispersión trans-Amazónica de Crotalus durissus durante el Pleistoceno

Two disjunct distributional areas of Crotalus durissus (Neotropical rattlesnake) are in open habitats north and south of the Amazon Basin and are presently separated by humid rainforest habitats. We used ecological niche modeling to identify and investigate potential dispersal pathways for this species between the two areas during the late Pleistocene. Niches estimated for the two populations did not differ significantly. Our analyses indicated two possible, but a single most likely, potential routes of dispersal during the last glacial cycle. These results are important to understanding the history of Amazon Basin humid forest biotas, as they suggest agents of isolation among putative humid forest refugia in the form of dry forest and scrub, and associated biotas.

Actualmente existen dos áreas de distribución disyuntas de la serpiente de cascabel Crotalus durissus, afín a hábitats abiertos, al norte y al sur de la cuenca del Río Amazonas, separadas por selvas húmedas. Usamos técnicas de modelado de nicho ecológico para identificar corredores potenciales de dispersión para esta especie entre las dos áreas en el Pleistoceno tardío. Los nichos estimados para las poblaciones de cada una de las áreas de distribución no presentaron diferencias significativas. Nuestros análisis identificaron un corredor de dispersión más probable para esta especie durante el Último Máximo Glaciar. Estos resultados tienen implicaciones para el entendimiento de la historia de las biotas de las selvas húmedas del Amazonas, ya que sugieren causas de aislamiento entre refugios potenciales de selva húmeda, en la forma de selva seca y matorral.